В 2020 году лаборатория ОЦ СПИД начала проводить ПЦР исследования на COVID-19.
В 2021 году проведена большая работа по организации системы менеджмента в диагностической лаборатории в связи с принятым решением о разработке системы менеджмента в ДЛ в соответствии с требованиями СТ РК ISO 15189-2015 «Лаборатории медицинские. Требования к качеству и компетентности» с дальнейшей аккредитацией ДЛ, как субъект аккредитации должны выполнять требования Закона РК «Об аккредитации в области оценки соответствия», требования Национального органа по аккредитации. В лаборатории были созданы условия для соблюдения критериев аккредитации в соответствии с требованиями СТ РК ISO 15189-2015 и обеспечением всеми необходимыми для этого ресурсами.
В 2023 году на национальном форуме лабораторной медицины «Современны тренды лабораторной медицины для клинических практик» диагностическая лаборатория Костанайского областного центра СПИД получила награду «Best Laboratory Award of Kazakhstan».На сегодняшний день Центр СПИД работает по различным направлениям деятельности: эпидемиологический отдел, отдел профилактических работ, отдел лечебно-профилактической помощи и диспансеризации, отдел организационно-методической помощи и диагностическая лаборатория.
За годы работы в Центре создана хорошая материально-техническая база, лаборатория оснащена современным автоматизированным оборудованием, сформировался квалифицированный кадровый состав. Количество сотрудников на текущий период составляет 102 физических лица, включающих медицинских и немедицинских сотрудников.
Центр успешно взаимодействует с ведомствами, неправительственными и общественными организациями в решении проблем, связанных с ВИЧ.
КГП «Костанайский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД» в своей деятельности руководствуется Кодексом Республики Казахстан «О здоровье народа и системе здравоохранения», отраслевыми нормативными правовыми актами.