В составе отдела 3 врача-эпидемиолога: Ергалиева Салтанат Бауржановна, Габдуллина Акмарал Боладовна, Каирбаева Асем Калимжановна.
В отделе для профилактических работ с ключевыми группами населения функционируют при ОЦ СПИД:
- 1 стационарный пункт доверия – медицинская сестра Нурмаганбетова Сауле Мурзахметовна
- 3 передвижных пункта пункта доверия – медицинские сестра Жалмухамбетова Гайния Чапаевна, Жусубекова Галия Жанбосыновна, Абишева Жанар Абугалиевна.
При медицинских организациях расположены 12 стационарных пунктов доверия – г. Костанай, г. Рудный, г. Лисаковск, г. Житикара, г. Тобыл, районы – Карабалык, Сарыколь, Мендикара, Аулиеколь, Федоровский, Кушмурун, ст. Тобол.
Задачами отдела являются проведение мониторинга и оценки эффективности внедряемых профилактических программ среди ключевых групп населения, в том числе координацию работы ПД, волонтеров и аутрич – работников, а также информирование населения о путях распространения и методах предупреждения заражения ВИЧ-инфекцией.
Профилактическую работу среди молодежи, учащихся ВУЗов, СУЗов, ССУЗов проводит педагог – Қадрон Серік Аузбайұлы.
 

Основные функции отдела
1.Организации, проведение профилактических мероприятий, направленных на предупреждение распространения ВИЧ на территории области (города), среди ключевых групп населения, уязвимых к ВИЧ и населения в целом.
2.Координация деятельности по сбору, хранению и анализу данных о результатах мониторинга и оценки, включая данные эпидемиологического надзора, программного и финансового мониторинга;
3.Оказание организационно-методической помощи государственным организациям, ведомственным, НПО и общественным организациям в реализации профилактических мероприятий, а также подготовке педагогов, учащихся, родителей, подростков, волонтеров и молодежи по вопросам профилактики ВИЧ и СПИД.
4.Проведение конференций, круглых столов, семинаров по вопросам профилактики ВИЧ и СПИД различных групп населения, а также подготовка статей и тезисов, публикаций в медицинские издания.
5.Участие в мероприятиях, посвященных проблемам ВИЧ и СПИД, с привлечением средств массовой информации.
6.Участие в разработке и распространении образовательных программ, учебных и наглядных пособий, информационных материалов по проблеме ВИЧ и СПИД на государственном и русском языках для различных групп населения;
7.Организация и проведение мероприятий, посвященных «Дню памяти умерших от СПИДа», «Дню борьбы с наркоманией», «Всемирному дню борьбы со СПИДом».