АИТВ-инфекциясының белгілері аурудың сатысына байланысты өзгереді. Әдетте, АИТВ-инфекциясы ешқандай жолмен көрінбейді және көптеген адамдар АИТВ-ға қан анализінен өтіп, кейінгі кезеңдерде олардың мәртебесі туралы біледі.
Ауру 5 кезеңнен тұрады: қанда вирусқа қарсы антиденелер болмаған кезде инкубация және 4 клиникалық, антиденелер анықталып, аурудың белгілері пайда болған кезде: біріншілік көріністер кезеңі, АҚТҚ-ның жасырын кезеңі, ауру кезеңі. екіншілік аурулар және АҚТҚ-ның терминалдық кезеңі.
Бірінші кезеңде вирус адам ағзасына енеді және иммундық жүйе белсенді түрде қарсылық көрсете бастағанға дейін АИТВ тез көбейіп, иммунитетке жауапты жасушаларды зақымдайды. АИТВ ағзаға түскен сәттен бастап ауру белгілері пайда болғанға дейінгі кезең серологиялық терезе деп аталады. Бұл уақытта иммун тапшылығы вирусына реакция теріс, өйткені нақты антиденелер әлі анықталмаған. Бұл кезеңнің ұзақтығы әдетте 3 аптадан 3 айға дейін созылады, бірақ жекелеген жағдайларда ол 1 жылға дейін созылуы мүмкін.
АИТВ-ның бұл кезеңінің ұзақтығы орта есеппен 2-3 аптаны құрайды, ол адамдардың көпшілігінде жасырын болады.
Бастапқы көріністердің кезеңі АИТВ-инфекциясының немесе иммун тапшылығы фонында дамитын ілеспе аурулардың көріністері болмаған кезде симптомсыз түрде де болуы мүмкін. Дененің вирустың енуіне реакциясы тек антиденелерді өндіру арқылы көрінеді. Асимптоматикалық түрі көп жағдайда АҚТҚ-ға қан сынағы арқылы диагноз қойылады.
АИТВ-ның жасырын кезеңі иммун тапшылығының біртіндеп жоғарылауымен сипатталады. Осы кезеңде иммундық жасушалардың өлімі олардың өндірісінің жоғарылауымен өтеледі. Бұл кезеңде АҚТҚ қан плазмасында антиденелердің болуына тестілеу арқылы диагноз қойылады. Сыртқы белгілер лимфа түйіндерінің ұлғаюын қамтуы мүмкін. АИТВ-ның жасырын кезеңі 2-3 жылдан 20 және одан да көп жылға дейін созылады. Орташа алғанда ол 6-7 жылға созылады.
Екіншілік аурулардың сатысы көріністерінің ауырлығына байланысты формаларға бөлінеді (4 А-В). Бұл кезеңде прогрессивті иммун тапшылығы фонында вирустық, бактериялық, саңырауқұлақтық сипаттағы қатар жүретін (оппортунистік) инфекциялар, сондай-ақ қатерлі түзілімдер пайда болады. Кезеңнің ұзақтығы 1-2 жыл.
Терминалды кезең қайтымсыз өзгерістермен сипатталады, АИТВ инфекциясын емдеу тиімсіз болады. Т-лимфоциттердің (CD4 жасушалары) саны төмендейді, науқастар кезеңнің басталуынан бірнеше апта немесе айлар ішінде өледі.
АИТВ-инфекциясының ағымы өте әр түрлі, барлық кезеңдері кейде белгілі бір клиникалық белгілер болмауы мүмкін; Адам ағзасының жеке ерекшеліктеріне байланысты антиретровирустық терапия болмаған кезде аурудың ұзақтығы бірнеше айдан 15-20 жылға дейін созылады.
Адам өмірінің көптеген жылдарында АҚТҚ бар екенін білмеуі мүмкін. Дегенмен, емделмеген жағдайда иммундық жүйе дұрыс жұмысын тоқтатады және өмірге қауіп төндіретін қатарлас аурулар дамиды, бұл ақыр соңында өлімге әкелуі мүмкін. Сондықтан иммундық жүйеге елеулі зақым келтірмес бұрын АИТВ-ны ерте анықтау және емдеуді бастау өте маңызды.